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圣路易斯華盛頓大學生物醫(yī)學工程系開設有5種研究生學位項目，分別是：
生物醫(yī)學工程碩士：為期1年，MS+研究論文計24個學分，MS不帶研究論文計30個學分，要求申請者擁有工程學、物理、數(shù)學等本科專業(yè)背景，此外，要求申請者學習過相關課程（如：高級微積分與微分方程、概率與統(tǒng)計、工程數(shù)學、物理、計算機科學基礎、電路與電氣、分子與細胞生物學、有機化學等），如有相關研究實驗室經歷可在材料中提供。
生物醫(yī)學工程專業(yè)碩士：為期1年，共計30個學分，屬于專業(yè)碩士學位項目，以實踐為主，無需撰寫研究論文，僅面向美國本土學生申請。
生物醫(yī)學工程博士項目：為期4-6年，共計72個學分，要求申請者擁有工程學、物理、數(shù)學等本科或碩士專業(yè)背景，此外，要求申請者學習過相關課程（如：高級微積分與微分方程、概率與統(tǒng)計、工程數(shù)學、物理、計算機科學基礎、電路與電氣、分子與細胞生物學、有機化學等），如有相關研究實驗室經歷可在材料中提供。
生物醫(yī)學工程碩士與工商管理碩士聯(lián)合項目
醫(yī)學博士項目與生物醫(yī)學博士聯(lián)合項目：直接在圣路易斯華盛頓大學醫(yī)學培訓項目中申請即可。
圣路易斯華盛頓大學生物與生物醫(yī)學部共開設有12個博士項目，統(tǒng)一通過文理研究生院申請，無申請費。
PhD項目為期4-6年，共計72個學分，要求申請者擁有自然科學、物理、工程學等相關專業(yè)本科背景，部分項目要求申請者學習過生物、化學、生物化學、微積分、物理等課程。該項目每年收到的申請大概有1000余份，錄取名額僅80個，其中，國際學生錄取率占30%。
| 排名 | 學校 | 專業(yè)（major） |
|---|---|---|
| 1 | 約翰霍普金斯大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 1 | 麻省理工學院 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 3 | 杜克大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 3 | 喬治亞理工大學埃默里大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 5 | 斯坦福大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 5 | 加州大學伯克利分校 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 5 | 加州大學圣地亞哥分校 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 5 | 賓夕法尼亞大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 9 | 波士頓大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 10 | 哥倫比亞大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 10 | 萊斯大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 10 | 密歇根大學安娜堡分校 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 10 | 華盛頓大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 14 | 康奈爾大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 14 | 西北大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 14 | 明尼蘇達大學雙城分校 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 14 | 圣路易斯華盛頓大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 18 | 加州理工學院 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 18 | 凱斯西儲大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 18 | 匹茲堡大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 18 | 德克薩斯大學奧斯汀分校 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 22 | 卡內基梅隆大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 22 | 范德堡大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 24 | 哈佛大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 24 | 加州大學戴維斯分校 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 24 | 弗吉尼亞大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 24 | 威斯康星大學麥迪遜分校 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 28 | 普渡大學西拉法葉分校 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 28 | 加州大學洛杉磯分校 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 30 | 伊利諾伊大學香檳分校 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 30 | 南加州大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 30 | 耶魯大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 33 | 北卡羅來納大學教堂山分校 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 33 | 匹茲堡州立大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 33 | 加州大學歐文分校 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 33 | 佛羅里達大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 33 | 馬里蘭大學帕克分校 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 38 | 德州農工大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 38 | 猶他大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 40 | 克萊姆森大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 40 | 俄亥俄州立大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 40 | 倫斯勒理工學院 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 40 | 弗吉尼亞理工威克森林大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 44 | 特拉華大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 45 | 布朗大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 45 | 東北大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 45 | 羅格斯大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 45 | 塔夫茨大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 45 | 伊利諾伊大學芝加哥分校 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
| 45 | 羅切斯特大學 | 生物醫(yī)學/生物工程 |
